Названа по находившемуся в этой местности Головинскому дворцу и в честь его владельца Ф. А. Головина (1650-1706) — графа, генерал-фельдмаршала, дипломата.

В истории Головинского района переплелись истории трех сел: Никольского, Головина и Михалкова. История каждого из них по-своему удивительна и неповторима.

О селе Никольском первые упоминания в документах появляются уже в 1498 году, а о селе Головино – в начале XVI столетия. Последнее было для московских дачников и паломников культурным и духовным центром благодаря Казанской Головинской обители, построенной в конце XIX века.